Научно-исследовательская лаборатория № 3 была первой НИЛ, созданной в институте. Она образована в 1975 году и в своем развитии прошла три периода. Проведение исследований осуществляется по трем научным направлениям:
- исследование путей совершенствования систем эксплуатации физических
установок с повышенным уровнем безопасности перспективной номенклатуры
комплексов;
- исследование проблем и разработка предложений по совершенствованию
системы предотвращения несанкционированного применения ЯО;
- исследование длительной прочности металлоконструкций агрегатов в интересах оценки их остаточного ресурса.
В настоящее время в составе НИЛ-3 трудятся 4 кандидата технических наук, двое из них имеют ученое звание "старший научный сотрудник" и один - "доцент". Старший научный сотрудник Бородай В.Э. является лауреатом Государственной премии.
В плане повышения научного потенциала готовятся одна докторская диссертация (старший научный сотрудник Попов А.Г.) и три кандидатские диссертации (адъюнкт подполковник Купцов А.А., научный сотрудник майор Мурашко И.А. и старший инженер майор Фролов Р.В.
Первым начальником НИЛ был назначен подполковник 31 Петров. В дальнейшем лабораторией руководили: полковник Попов И.Г, половник Бородай, полковник Смуров С.В. В настоящее время лабораторию возглавляет подполковник Василенко Н.В.